內設股室：辦公室、預算股(國庫股)（政府性債務管理辦公室）、行財股、社保股、農業股、經建股、綜合股(企業股)、會計股(行政審批股)、農村財政管理股(農村綜合改革工作辦公室)、金融監管股、國有資產監督管理股；

       二級機構：會計中心（國庫支付中心）、非稅收入管理服務中心、民生工程事務中心、金融管理服務中心；

       股級事業單位：財政監督評價中心（政府采購中心、預算績效評價中心合署辦公）、中小企業融資擔保中心、縣信息中心、績溪縣政府和社會資本合作服務中心